|
|
Dyskusja wikipedysty:Shape
[edytuj] Metabolizm paracetamolu.Cześć Witku! Czy masz może chęć i czas, żeby wykonać grafikę przedstawiającą metabolizm paracetamolu? Na Commons są 2 grafiki na licencji PD, więc można je dowolnie zmieniać, co się korzystnie składa, bo żadna z nich nie jest kompletna. Chciałabym, żeby nowa grafika była niejako połączeniem ich obu plus jeszcze trochę trzeba dodać, no i oczywiście podpisy muszą być w języku polskim. To niestety sporo pracy, dlatego napiszę poniżej w punktach, co trzeba by wykonać, a Ty zastanowisz się, czy to coś dla Ciebie i wtedy dasz mi odpowiedź. 1. Grafiki macierzyste to francuska i angielska. Korzystamy z grafiki francuskiej, zmieniając to i owo: 2. Cząsteczka paracetamolu na środku, tj. w grafice francuskiej, a jej linie lekko pogrubione tj. w angielskiej, pod cząsteczką podpis paracetamol. 3. Od cząsteczki Paracetamolu dwie strzałki, jedna w lewo, druga w prawo i obie skierowane nieco do góry, tak aby mieć więcej miejsca na dole. Czyli podobnie jak w grafice francuskiej, bo na razie z niej byśmy korzystali jako z matrycy. 4. Strzałka w lewą stronę: tuż nad strzałką małymi literkami napis: 50%, a pod strzałką sprzęganie. Pod cząsteczką napis "glukuronian paracetamolu", a litera G w kolorze niebieskim i pogrubiona. 5. Strzałka w prawą stronę: tuż nad strzałką napis: 30%, a pod strzałką sprzęganie. Pod cząsteczka napis: siarczan paracetamolu. Ale zamiast SO3 należałoby domalować tj. na grafice angielskiej, czyli z wiązaniami odchodzącymi od atomu siarki S. Cała reszta, poza atomem tlenu O przy pierścieniu benzenu, w kolorze niebieskim. 6. Domalować strzałkę odchodzącą od cząsteczki paracetamolu na środku (pomiędzy tymi, które już są) i skierowana do góry. Na końcu strzałki napisać małymi literkami: postać niezmieniona w moczu, a przy strzałce 5%. ] 7. Zrobić linię przerywaną w szerz grafiki, jakby w połowie cząsteczki paracetamolu, ale nie przechodzi ona prze sama cząsteczkę. Dzieli jedynie pole grafiki na część górną (to co już jest narysowane, czyli siarczan i glukuronian paracetamolu oraz postać niezmieniona) i dolną. Po lewej stronie nad linią napisać: szlak nieoksydacyjny, zaś pod linią utlenianie. Uff, to jakby część pierwsza (połowa) całości zmian w grafice. Masz jeszcze chęć się za to zabrać? Pozdrawiam czekając na Twoją odpowiedź. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 14:44, 4 lip 2008 (CEST)
To co już wykonałeś jest OK i ładnie wygląda! Jutro nie będzie mnie w sieci (także we wtorek i chyba w środę) i w ogóle w nadchodzącym tygodniu będę "w rozjazdach", co trochę skomplikuje nam współpracę nad grafiką, ale nie ma pospiechu. Poniżej podam w punktach kolejne czynności. Gdybyś utknął, to nie przejmuj się. Jak tylko będę w sieci, to zaraz się z Tobą skontaktuję. Na dziś serdecznie pozdrawiam i bardzo serdecznie dziękuję za pierwszą część grafiki. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 17:33, 5 lip 2008 (CEST) 1. Dołącz z grafiki angielskiej do cząsteczki paracetamolu ciąg reakcji, które rozpoczynają się od strzałki z napisem "Monooxygenaze hydroxylation". 2. Zamiast "Monooxygenaze hydroxylation" napisz: nad strzałką 4%, zaś tuż pod strzałką CYP2E1. 3. Cząsteczkę w nawiasie kwadratowym opisz: postać przejściowa (wolny rodnik). 4. Zamiast "Rearrangement" napisz: alkilowanie. 5. Cząsteczkę podpisz NAPQI i narysuj ja na czerwono. 6. Napis "Glutatione conjugation" zmień na: sprzężenie z glutationem. 7. Wyraz Glutathione w cząsteczce zamień na glutation i napisz w kolorze zielonym. 8. Daj strzałkę od powyższej cząsteczki i napisz nad nią: hydroliza. 9. Narysuj taka samą cząsteczkę, ale zamiast glutationu napisz: cysteina, zaś cząsteczkę podpisz: sprzężenie z cysteiną. 10. Narysuj ponownie nową strzałkę i napisz nad nią: acetylacja. 11. Narysuj taką samą cząsteczkę, jak poprzednia, ale napisz nad cysteiną: N-acetyl. 12. Podpisz cząsteczkę: sprzężenie z kwasem merkapturowym. Nowy szlak: 1. Napis "Toxicity" zmień na nad strzałką: Brak glutationu, a pod strzałką napisz: toksyczność. 2. Napis "Reactions with proteins and nucleic acids" zmień na: NAPQI reaguje z białkami i kwasami nukleinowymi - martwica wątroby, nerek i innych (płuca, neutrofile) 3. Dorysuj w wolnym miejscu, chyba po prawej stronie jeszcze jedną strzałkę bezpośrednio od paracetamolu w dół. 4. Nad tą strzałka napisz 3%, a pod nią CYP2A6 i CYP2B1. 5. Narysuj cząsteczkę paracetamolu, ale dorysuj do pierścienia jeszcze jedna grupę -OH tuz obok tej, która już jest, ale "na godzinie 5-tej". 6. Podpisz tą cząsteczkę: 3-hydroxy paracetamol.
postać niezmieniona w moczu (oczywiście bez tych przesadnych odstępów w pionie).
CiÄ…g dalszy za +/- kwadrans. Na razie. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 08:39, 7 lip 2008 (CEST)
Czerwona cząsteczka NAPQI Strzałka w dół ↓ do: (Zrób coś takiego:[2], czyli dorysuj półokrągłą kreseczkę do tej strzałki= wprowadzenie glutationu). Cząsteczki paracetamolu z zielonym podstawnikiem glutationu, podpis pod cząsteczką: sprzężenie z glutationem. Nowa strzałka w dół ↓ od tejże do: (opis przy strzałce: hydroliza) Cząsteczki paracetamolu z cysteiną. Opis pod cząsteczką: sprzężenie z cysteiną. Nowa strzałka w dół ↓ od tejże do: (opis przy strzałce: acetylacja) Cząsteczki z N-acetylo-cysteiną. Opis: sprzężenie z kwasem merkapturowym'. Aktualnie te strzałki stoją z boku, gdy tymczasem mają prowadzić od jednego związku do drugiego w kolejności NAPQI - paracetamol z glutationem - paracetamol z cysteiną - paracetamol z kwasem merkapturowym. Plus teraz mamy o 1 strzałkę ( z napisem acetylacja) za dużo. Wiesz Witku, już nawet mnie się wszystko pomieszało! Proszę wykonaj to, co uda Ci się zrozumieć z tej gmatwaniny, a potem będziemy dalej dopracowywać. A najważniejsze nie denerwuj się, jak czegoś nie zrozumiesz. Dam znać w czwartek popołudniu. Serdecznie pozdrawiam. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 10:20, 7 lip 2008 (CEST) [edytuj] Grafika metabolizm paracetamoluDrogi Witku! Jest mi przykro, że masz przeze mnie tyle pracy, w dodatku mało twórczej, bo to same wzory cząsteczek. Podziwiam Cię, że znalazłeś chęci i czas! Jestem Ci bardzo wdzięczna. Pojutrze wszystko posprawdzam i dam Ci znać, bo trochę pokomplikowała mi się sytuacja zewnętrzna. Na pierwszy rzut oka jest OK. Zauważyłam jedynie kosmetyczne poprawki. Dziękuję za wszystko, co już do tej pory zrobiłeś! Serdecznie pozdrawiam. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 22:10, 9 lip 2008 (CEST)
[edytuj] Drobne zmianyDzień dobry Witku! Wszystko jest jak należy. Grafika jak sam zauważyłeś jest dość wydłużona. Może rozwiążemy to w ten sposób, że:
Zauważyłam, że trzeba jeszcze nieco zmienić opis dwóch strzałek:
I to tyle. Zobacz i oceń sam, jak się będzie prezentować "zakręcenie" łańcucha przemian do środka. Dziękuję za dokonanie wszystkich poprawek i dorysowanie szlaku dla 3-metoksy-paracetamolu. Serdecznie pozdrawiam. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 09:10, 11 lip 2008 (CEST)
Hej Witku! Grafika bardzo mi się podoba. Miałam inną koncepcję, ale Twoja koncepcja "wyrównania cząsteczek" jest lepsza i ładniejsza. Dziękuję. Napisz jeszcze zamiast "wprowadzenie glutationu" po prostu "glutation" - przy tej półkolistej strzałce, bo taka półkolista strzałka do strzałki oznacza sama w sobie, że ten związek chemiczny (w tym przypadku glutation) włącza się do reakcji chemicznej. Wiesz, zdaję sobie sprawę, że to nie było łatwe dla Ciebie, ani dla mnie, bo biochemię miałam x lat temu, ale udało nam się! Już nie dzisiaj, bo najwyższy czas iść spać, ale jutro lub jak będziesz miał czas, to opisz grafikę "Metabolizm paracetamolu" i wstaw jako svg na Commons i dopasuj kategorie tj. w grafice angielskiej, czyli kategoria paracetamol, biochemia, patologia, fizjologia. Następnie poproszę Cię o wstawienie grafiki do artykułu o paracetamolu, do rozdziału "Metabolizm" na miejscu, gdzie teraz znajduje się tabelka pt.Metabolity procentowo. Tabelkę musisz najpierw usunąć, tylko daj dokładny opis w opisie zmian, np. "usunięcie tabelki i zrobienie miejsca na schemat z tymi samymi danymi", żeby jakiś (nadgorliwy) admin nie posądził Cię o wandalizm. A propos ta koszmarna tabelka to moje "dzieło". Włożyłeś w grafikę bardzo dużo pracy i chciałabym, żeby w historii tego artykułu stał Twój nick. Jeszcze raz dziękuję. Dobranoc. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 00:48, 12 lip 2008 (CEST) [edytuj] Nowa wersjaCześć Witku! Nowa wersja jest lepsza - spokojna i uładzona, a nie taka "busy". Dziękuję, że jeszcze pogłówkowałeś nad ostatecznym wyglądem. Gdybyś chciał zapełnić wewnętrzne pole, to też jest to możliwe, bo jest jeszcze jedna reakcja chemiczna, którą pominęłam, bo dotyczy zaledwie 0,7% paracetamolu. Boję się jedynie, że wtedy znowu zrobi się "busy", ale możesz spróbować dorysować i zobaczyć jak się będzie ostatecznie prezentować.
Nie znam się na licencjach, może taka sama jak w przypadku grafiki francuskiej i angielskiej, czyli dowolne wykorzystanie. Grafiki chyba nie opisujmy w grafice, wystarczy że jej tytuł będzie brzmiał "Metabolizm paracetamolu". Po wstawieniu do hasła dokładnie opiszę grafikę, czyli "Uproszczony schemat ilustrujący metabolizm i wydalanie paracetamolu u człowieka", skoro Ty nie chcesz tego zrobić, a szkoda. Ja w dalszym ciągu Cię zachęcam. W ten sposób Twój wkład zostanie zaznaczony w historii artykułu. To hasło to efekt pracy wielu osób, między innymi Mruga, Polimerka i Michała Sobkowskiego, ale jeszcze tuzin innych osób wprowadził drobniejsze, lecz cenne poprawki. Nie można być specjalistą od wszystkiego, dlatego tak konieczna jest współpraca w hasłach interdyscyplinarnych. Serdecznie pozdrawiam. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 13:21, 13 lip 2008 (CEST)
[edytuj] PodziękowanieWitku! Nie spodziewałam się, że w sumie tak szybko grafika "stanie się ciałem". Bardzo się cieszę, że po raz kolejny zechciałeś podjąć się wykonania grafiki, tym razem ilustrującej metabolizm paracetamolu w ustroju. Serdecznie Ci dziękuję za możliwość współpracy. Proszę wstaw na swoją stronę Wikipedysty symboliczną gwiazdkę. Pozdrawiam. --Lidia Fourdraine (dyskusja) 17:40, 14 lip 2008 (CEST) |